Ozonowanie jest czynnością składową dezynfekcji – procesu usuwania zanieczyszczeń biologicznych: bakterii, wirusów i grzybów. Aczkolwiek jest to metoda zaawansowana, gdyż w standardowo przeprowadzanej dezynfekcji nie musi być stosowana, a najczęściej wykorzystuje się wówczas: parę wodną, promieniowanie oraz różnego rodzaju związki chemiczne.